(advertentie)

Kunnen we eiwitten van het coronavirus dat covid-19 veroorzaakt, detecteren in patiëntenmateriaal?

Die vraag kwam op bij dr. Jeroen Demmers toen de werkzaamheden in het Proteomics Center van het Erasmus MC  grotendeels stil kwamen te liggen ten gevolge van de coronapandemie.

Demmers is directeur van die core facility, dat het neusje van de zalm herbergt als het aankomt op apparatuur om eiwitten te analyseren. Demmers: ‘Omdat hier alle top-apparatuur en expertise is geclusterd, werken we veel samen met onderzoeksgroepen van het Erasmus MC en daarbuiten. Het meest recent met de groep van dr. Bart Haagmans van de afdeling Viroscience van het Erasmus MC. Niet heel verrassend betreft dat onderzoek naar het coronavirus dat covid-19 veroorzaakt.’

Keelslijm
‘Het coronavirus herbergt een stuk of tien eiwitten. Sommige bevinden zich aan de buitenkant, en spelen een rol bij de aanhechting van het virusdeeltje aan bijvoorbeeld cellen uit de luchtwegen. Andere eiwitten beschermen het RNA, het genetisch materiaal van het virus. De meest gebruikte techniek om virusdeeltjes op te sporen is gericht op dat RNA. Wij onderzoeken of we ook die eiwitten kunnen detecteren.’

Veel hebben de onderzoekers daarvoor niet nodig. Een beetje keelslijm is voldoende. Dat wordt op een glazen plaatje aangebracht en behandeld met een enzym dat de aanwezige eiwitten in brokstukjes knipt. Die minuscule fragmentjes worden met een massaspectrometer geanalyseerd.

‘Dat is een extreem gevoelige ‘weegschaal’ die de massa, het gewicht van die eiwitfragmentjes kan bepalen’, legt Demmers uit. ‘Het apparaat doet dat zo nauwkeurig dat we de fragmentjes kunnen identificeren: we weten uit welke aminozuren ze zijn opgebouwd. Aminozuren zijn de bouwstenen van eiwitten. En omdat we de fragmentjes kunnen identificeren, kunnen we met behulp van computerprogramma’s het complete eiwit bepalen.’

Veelbelovend
Het is de onderzoekers gelukt om in verschillende monsters viruseiwitten te detecteren. ‘Dat is veelbelovend,’ zegt Demmers, ‘maar we hebben meer analyses nodig om harde conclusies te kunnen trekken, bijvoorbeeld over de relatie tussen de hoeveelheid viruseiwit in het keelslijm en de hevigheid van de ziekte bij de patiënt. We zijn dus ook hard op zoek naar manieren om meer onderzoeksmateriaal te verkrijgen.’

MERS
Al eerder was de samenwerking met de afdeling Viroscience vruchtbaar. Toen ging het om een ander coronavirus, het Middle East Respiratory Syndrome-coronavirus (MERS-CoV) dat ernstige luchtwegklachten kan veroorzaken. Dat virus werd in september 2012 ontdekt, voor het eerst in het Midden-Oosten. In 2013 publiceerden de Rotterdamse onderzoekers in het wetenschappelijk toptijdschrift Nature een belangrijke ontdekking: zij hadden het eiwit geïdentificeerd waar het virus aan bindt als het een cel infecteert. Demmers: ‘Die kennis is belangrijk omdat je bijvoorbeeld een medicijn kunt ontwikkelen dat voorkomt dat het virusdeeltje met dat eiwit bindt.’

 

Aanvullende info ...

Raadpleeg de bron en/of aanbieder voor meer informatie over dit bericht. Nieuws kan veranderen, fouten of onjuistheden omvatten. Lees ook onze disclaimer en rapporteer a.u.b. berichten, reacties en/of beeld die ingaan tegen onze voorwaarden.

Klik op de onderstaande tags voor relevante berichten, indien aanwezig ...

Naam auteur en/of bewerkt door: Erasmus MC / Gert Jan van den Bemd
Fotograaf of fotobureau: : INGImages
Bron bij dit artikel: : Erasmus MC
Wat is de URL bij deze bron?: https://amazingerasmusmc.nl/actueel/corona-eiwitten-op-het-spoor/
Originele titel: Corona-eiwitten op het spoor
Doelgroep: Zorgprofessionals, Studenten
Datum: 2020-10-22

Relevante artikelen ...

Menselijke fermentatie wordt in kaart gebracht door nieuwe methode Onze darmen bevatten biljoenen bacteriën Wetenschappers van het Maastricht UMC+ en de Universiteit Maastricht gaan voor het eerst in de adem van mens... Wetenschap & onderwijs Mon, 14 Jun 2021, 10:44:10
Gaat cannabis de groei van hersentumoren tegen? Naar effect van cannabis op hersentumoren wordt inmiddels onderzoek gedaan Wat is het effect van wietolie in de hersenen? Gaat cannabis de groei van ... Wetenschap & onderwijs Thu, 13 May 2021, 10:29:28
Onderzoek naar de korte- en langetermijneffecten van COVID-19 De meeste patiënten met COVID-19 hebben milde klachten en zieken thuis uit Het wordt steeds duidelijker dat ook een deel van de mensen met milde COVI... Wetenschap & onderwijs Tue, 20 Apr 2021, 10:49:42
Zoektocht naar oorsprong van het virus Het onderzoek rangschikt verschillende scenario’s op volgorde van waarschijnlijkheid Het is nog niet duidelijk waar ter wereld het coronavirus voor h... Wetenschap & onderwijs Wed, 31 Mar 2021, 19:00:40
Minimaal 61 genen spelen bij oogkleur een rol De genetica van oogkleur blijkt ingewikkelder dan gedacht Een kind met bruine ogen van ouders met blauwe ogen? Onmogelijk, dat moet er eentje van de ... Wetenschap & onderwijs Thu, 11 Mar 2021, 11:57:27
Studie naar behandeling polsbreuk om operatie te voorkomen Voor hun onderzoek, waar tien ziekenhuizen aan meewerken, hebben de onderzoekers 490.000 euro gekregen van ZonMW Jaarlijks breken circa 33.000 Nederl... Wetenschap & onderwijs Thu, 04 Feb 2021, 14:22:21